Il mercato estivo si apre con gli acquisti di Gamberini e Behrami dalla Fiorentina, Mesto dal Genoa ed El Kaddouri dal Brescia. Il Napoli sostituisce Lavezzi (PSG) con il rientro di Insigne dal Pescara. Salutano anche Gargano, Santacroce e Fideleff.

Svolto il consueto ritiro estivo a Dimaro, la stagione è aperta dalla sconfitta in Supercoppa Italiana contro la Juventus: a Pechino, gli azzurri vengono sconfitti per 4-2 ai supplementari.

In campionato i partenopei si classificano secondi, a −9 dalla Juventus: con 78 punti, il club stabilisce il suo primato per la massima serie. Edinson Cavani è capocannoniere con 29 reti: in precedenza, l'unico giocatore del Napoli ad aver vinto la classifica marcatori era stato Maradona nel 1987-88.

Il percorso in Europa League, iniziato dai gironi anziché dai play-off grazie alla vittoria della Coppa Italia, si rivela essere difficile. Pescato nel girone F assieme agli ucraini del Dnipro, gli olandesi del PSV e gli svedesi dell'AIK Solna, il Napoli ottiene 9 punti con 3 vittorie e altrettante sconfitte, passando il turno al secondo posto con una giornata d'anticipo grazie all'1-2 in Svezia, ma esce ai sedicesimi di finale contro il Viktoria Plzen perdendo con il punteggio complessivo di 5-0 (0-3 al San Paolo, 2-0 in Repubblica Ceca).

In Coppa Italia gli azzurri escono agli ottavi contro il Bologna perdendo al San Paolo per 1-2.