Secondo anno in Serie A con De Laurentiis. In panchina Reja. Arrivano Maggio, Denis, Aronica, Rinaudo e Russotto. Rosa sfoltita con le partenze di sette giocatori, Calaiò, Bucchi, De Zerbi, Garics, Domizzi, Rullo e Cupi.

Inizio promettente ed entusiasmante vittoria sulla Juventus (2-1 in goal Lavezzi e Hamsik). Nel ritorno, la squadra cala vistosamente. In otto partite, Reja realizza due punti. Donadoni lo sostituisce alla 28a giornata, ma senza risultati esaltanti a parte una vittoria sull'Inter firmata da Zalayeta (1-0). E' 12º posto dopo l'8º della stagione precedente.

Gli azzurri approdano in Coppa Uefa superando la qualificazione dell'Intertoto contro il Panionios (0-1 in Grecia, 1-0 a Napoli). Nel secondo turno dell'Uefa gli azzurri eliminano gli Albanesi del Vllaznia (0-3 fuori, 5-0 in casa), ma si arrendono al Benfica (3-2 in casa, 2-0 a Lisbona).

In Coppa Italia, con partite uniche, dopo aver superato la Salernitana (3-1), la squadra si arrende ai quarti di finale sul campo della Juventus perdendo il match ai rigori dopo lo 0-0 alla fine dei supplementari.