Il Napoli ha partecipato alla Coppa delle Coppe per 2 stagioni, senza mai vincere questo trofeo. Dal 1960 al 1994 gli azzurri hanno giocato in questa competizione 17 partite, ottenendo 9 vittorie, 4 pareggi e 4 sconfitte. In totale 23 gol fatti e 16 gol subiti.
| Competizione | Giocate | Vittorie | Pareggi | Sconfitte | Fatti | Subiti | G | V | P | S | GF | GS |
|---|
| Coppa delle Coppe | 17 | 9 | 4 | 4 | 23 | 16 | 17 | 9 | 4 | 4 | 23 | 16 |